O Basquete teve início no clube em 1926, porém em 1928 houve uma pausa, retomando em 1940. Em 1948 disputou o Campeonato Principal. Nos anos 50, sob a orientação do treinador Serafim Cruz, o basquete feminino foi destaque no cenário esportivo paulista e brasileiro com jogadoras que se tornaram conhecidas internacionalmente. Podemos destacar alguns nomes como Iracema Ferreira, Yolanda Ferraz (Yola), Wanda, Maria Aparecida Guimarães (Cida), Nair Kanawatti e Zilda Ulbrich, a famosa Coca, que em 1957, durante o Campeonato Mundial no Chile foi considerada a segunda melhor jogadora do mundo.
Em 2005 o Pinheiros voltou a disputar as categorias femininas contando, em 2006, com 3 equipes que disputaram os Campeonatos Oficiais da Federação. O basquete do Pinheiros tem sua força de trabalho nas categorias de base disputando sempre todos os Campeonatos Oficiais da Federação desde a categoria pré-mini até adultos, com a conquista de diversos títulos, mantendo também equipes fortes nos Campeonatos da União de Veteranos do Brasil.